羊场消毒的目的是消灭传染源散播于外界环境中的病原微生物切断传播途径，阻止疫病继续蔓延。羊场应建立切实可行的消毒制度，定期对羊舍地面土壤、粪便、污水、皮毛等进行消毒。

　    羊舍

　　羊舍除保持干燥、通风、冬暖、夏凉以外，平时还应做好消毒。一般分两个步骤进行：第一步先进行机械清扫；第二步用消毒液。羊舍及运动场应每周消毒一次，整个羊舍用2％－4％氢氧化钠消毒或用1∶1800～3000的百毒杀带羊消毒。

　　入场

　　羊场应设有消毒室，室内两侧、顶壁设紫外线灯，地面设消毒池，用麻袋片或草垫浸4％氢氧化钠溶液，入场人员要更换鞋，穿专用工作服做好登记。

　　场大门设消毒池，经常喷4％氢氧化钠溶液或3％过氧乙酸等。消毒方法是将消毒液盛于喷雾器，喷洒天花板、墙壁、地面，然后再开门窗通风用清水刷洗饲槽、用具，将消毒药味除去。如羊舍有密闭条件，舍内无羊时，可关闭门窗，用福尔马林熏蒸消毒12小时～24小时，然后开窗通风24小时，福尔马林的用量为每立方米空间25毫升～50毫升，加等量水加热蒸发。一般情况下，羊舍消毒每周1次，每年再进行2次大消毒。产房的消毒，在产羔前进行1次，产羔高峰时进行多次，产羔结束后再进行1次。在病羊舍、隔离舍的出入口处应放置浸有4％氢氧化钠溶液的麻袋片或草垫以免病原扩散。

　　地面

　　土壤表面可用10％漂白粉溶液，4％福尔马林或10％氢氧化钠溶液。停放过芽孢杆菌所致传染病（如炭疽）病羊尸体的场所，应严格加以消毒首先用上述漂白粉溶液喷洒地面，然后将表层土壤掘起30厘米左右，撒上干漂白粉与土混合，将此表土妥善运出掩埋。

　　粪便

　　羊的粪便消毒方法有多种，最实用的方法是生物热消毒法，即在距羊场100米～200米以外的地方设一堆粪场，将羊粪堆积起来，喷少量水上面覆盖湿泥封严，堆放发酵30天以上，即可作肥料。

　　污水

　　最常用的方法是将污水引入处理池，加入化学药品（如漂白粉或其他氯制剂）进行消毒，用量视污水量而定，一般1升污水用2克～5克漂白粉。